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層浪流式筆記的開篇,由《細胞周期的制備和檢測》拉開序幕。不忘初心,方得始終。欄目全新啟航,我們選擇依然續(xù)寫流式與細胞周期的故事。本期為大家?guī)淼氖牵?strong style="-webkit-tap-highlight-color: transparent; margin: 0px; padding: 0px; outline: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box !important; overflow-wrap: break-word !important;">細胞周期的數(shù)據(jù)質量評估和常見應用場景。
工欲善其事,必先利其器。漂亮的細胞周期數(shù)據(jù)離不開性能優(yōu)異的儀器,因此,首先需要通過《中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY/T 0588-2017》[1]來評估流式細胞儀的性能。本文中使用BD的DNA質量控制試劑盒,對層浪流式細胞儀檢測到的DNA數(shù)據(jù)進行質量評估。
?? 小雞紅細胞核(CEN):用于建立測試條件。
CEN試劑經過特殊處理,內含單個核、雙聯(lián)體核、三聯(lián)體核和更大的聚集體,用來檢測儀器的線性度和分辨率。經PI染色后,由于細胞核聚集程度的不同,在PI的直方圖中會出現(xiàn)至少4個峰,前4個峰分別代表單個核、雙聯(lián)體核、三聯(lián)體核和四聯(lián)體核。若染色正常,儀器線性度良好,則四個峰所在道數(shù)的平均比值接近1:2:3:4。
?? 小牛胸腺細胞核(CTN):具有一個完整的細胞周期,且具有細胞周期的各個時期,大部分核處于G0/G1期,小部分處于S期和G2/M期。還可作為細胞周期統(tǒng)計分析的質控。
?? 2μm的熒光微球:作為一種穩(wěn)定的非生物標準品來確認儀器的CV(細胞離散度),要求儀器CV<2.3%。
?? 核酸染料碘化丙啶(PI)
圖1:DNA QC試劑盒數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)評估結果:
出現(xiàn)明顯7峰,且檢測CEN結果為(圖1A)PK1:PK2:PK3:PK4:PK5:PK6:PK7 = 1.00:2.00:2.99:3.97:4.94:5.93:6.87 (≈1:2:3:4:5:6:7)。
【行業(yè)要求CEN結果滿足至少出現(xiàn)4個峰,且前四個峰的比值接近1:2:3:4】
02
CTN檢測結果為周期擬合G2/G1=2.01(圖1B)。
【行業(yè)要求G2/M與G0/G1的平均熒光強度比值在1.95-2.05之間】
03
2μm微球結果CV=1.75%(圖1C)。
【行業(yè)要求CV<2.3%】
綜上可得,層浪流式細胞儀在DNA檢測中表現(xiàn)良好,QC數(shù)據(jù)均遠超行業(yè)標準,滿足臨床/科研實驗需求,是流式分析細胞周期的卓越選擇。
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細胞系是周期實驗研究常用的樣本,如圖2分別依次為A圖:MCF-7乳腺癌細胞系、B圖:MDA-MB-231乳腺癌細胞系、C圖:HL-7702[L-02;LO2]肝細胞系。不同細胞系周期檢測及擬合結果如下圖所示:
圖2:常見細胞系自動周期擬合
1
三種細胞系檢測到的CVG1值分別為:MCF7-1.63%、231-2.09%、LO2-2.93%。
【正常二倍體的CVG1應<8%】
注
G0/G1峰的CV(CVG1)顯著影響S期計算的準確性,然而在實際應用中,由于腫瘤樣本會存在多個亞群,其CVG1值可能會偏高,影響結果。建議將CVG1<8%的腫瘤樣本用于有用的S期測定。
2
檢測到的RCS(限制性立方樣條回歸,用來反映樣本的擬合程度)分別為:3.55、2.78、3.70。
【RCS<3.0,表示擬合良好;RCS在3.0-5.0,被認為是基本擬合;RCS>5.0,表明擬合匹配度差】
在生殖相關研究中,生殖細胞不同時期百分比的變化一直是研究的重點。以C57BL/6小鼠精囊為例,可以檢測到不同時期的細胞數(shù)量百分比:亞倍體(sub1N)細長精子細胞;單倍體(1N)圓形精子細胞;二倍體(2N)精原細胞;四倍體(4N)精原細胞G2M期。使用層浪流式細胞儀PI檢測精細胞周期結果如圖3所示:
圖3:C57BL/6小鼠精囊周期檢測
亞倍體(sub1N)和單倍體(1N)百分比為64.66%、二倍體(2N)百分比為7.52%、四倍體(4N)的百分比為20.84%,與文獻報道中正常C57BL/6生殖細胞占比一致。[2]
植物細胞的多倍化對于研究個體生長發(fā)育具有重要的生物學意義。流式細胞儀檢測植物倍體具有簡單、快速、準確、直觀等優(yōu)點,在植物學中有著越來越廣泛的應用價值。模式生物擬南芥是植物倍體研究的經典角色,用層浪流式細胞儀對其葉片倍體進行檢測和分析,得到圖4結果:
圖4:擬南芥葉片周期檢測
PK1:PK2=1:1.9,接近1:2。
植物周期檢測一般不用周期擬合軟件擬合,根據(jù)標準品確定樣本有單倍體、二倍體、四倍體,或者多倍體。植物可以檢測的樣本有:根、莖、葉、種子、花等。
總結
層浪流式細胞儀對DNA QC試劑盒(CEN/CTN/微球)的各項檢測結果均表現(xiàn)優(yōu)異,表明儀器的性能不僅滿足各類樣本細胞周期檢測的需求,其檢測結果更是遠優(yōu)于行業(yè)檢測標準的要求,特別是CEN檢測,可以檢測出多個峰值,且符合倍比關系。
除此之外,層浪流式細胞儀分析軟件ModelFlower內置細胞周期分析功能,可以對周期數(shù)據(jù)進行一鍵擬合,并有批量分析與批量數(shù)據(jù)導出的功能。
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周期數(shù)據(jù)對于細胞收集量有什么要求?
除去碎片之外,建議可供分析的目的細胞在1萬以上,雖然細胞數(shù)據(jù)過大會影響到分析的速度,但不會對細胞各個時期的百分比檢測產生影響,擬合效果反而更好,因此在條件允許的情況下,收集量多多益善。
周期擬合不準確可以自行調整嗎?
可以的。且自動擬合之后如不滿意結果,也可以通過手動調整的方式,改變G1和G2門的位置,還可以批量應用到其他樣本中以保持一致性。
周期檢測可能會受到哪些因素的影響?
首先,不同細胞系的擬合效果存在差異。其次,影響周期擬合效果的因素還有:試劑盒差異、細胞固定方式的影響、收集細胞量的差異、人為操作影響等。因此,為了盡量減少差異,操作標準要規(guī)范,最大程度上避免操作誤差。
參考文獻
[1]中華人民共和國醫(yī)藥行業(yè)標準YY/T 0588-2017,流式細胞儀.國家食品藥品監(jiān)督管理局.2017.
[2]R.B. Struijk,1 C.M. De Winter-Korver,1 S, Simultaneous Purifification of Round and Elongated Spermatids from Testis Tissue Using a FACS-Based DNA Ploidy Assay,International Society for Advancement of Cytometry.
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